Jurusan Peternakan sebagai salah satu pelaksanaan akademik di Politani Negeri Kupang ditetapkan melalui Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia Nomor 252/O/1997 Tanggal 6 Oktober 1997 bagian Kelima Pasal 17 dan 18.
Pada awal berdirinya, Peternakan hanya memiliki satu program studi (PS) yakni PS Produksi Ternak. Pada tahun-tahun berikutnya terjadi penambahan dua program studi sehingga saat ini Jurusan Peternakan memiliki tiga program studi, yakni PS Produksi Ternak (D-III), PS Kesehatan Hewan (D-III) dan PS Teknologi Pakan Ternak (D-IV). Tahun 2026, terjadi penambahan 1 program studi baru yaitu PS Teknologi Produksi Ternak.
Untuk menunjang terlaksananya aktivitas program studi, terdapat 6 laboratorium yang ada di Jurusan Peternakan, yaitu Laboratorium Umum, Laboratorium Nutrisi dan Pakan Ternak, Laboratorium Produksi dan Reproduksi Ternak, Laboratorium Kesehatan Hewan, Laboratorium Anatomi dan Patologi, Laboratorium Teknologi Pakan Ternak, 1 unit Pabrik Mini Pakan ternak, 1 (satu) unit Klinik Kesehatan Hewan serta fasilitas penunjang lainnya.
Dalam kaitannya dengan akreditasi, maka Program Studi Produksi Ternak (D-III) dan Kesehatan Hewan (D-III) dan Program Studi Teknologi Pakan Ternak (D-IV) memperoleh status penilaian akreditasi B.